Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDLIM2Q96JY6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms