Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGBD1Q96JS3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms