Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCMH1Q96GD3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms