Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LTV1Q96GA3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LTV1Q96GA3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms