Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNFT2Q96EX2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms