Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM12Q96EX1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMIM12Q96EX1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMIM12Q96EX1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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