Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC10A4Q96EP9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC10A4Q96EP9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms