Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MTERF3Q96E29 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms