Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NXNL1Q96CM4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms