Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4CQ96CF2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4CQ96CF2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms