Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP4Q969X6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms