Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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TRIM63Q969Q1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRIM63Q969Q1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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