Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSR2Q969E8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSR2Q969E8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms