Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATRIPQ8WXE1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRIPQ8WXE1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms