Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBEC4Q8WW27 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms