Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHTF18Q8WVB6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms