Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29Q8TEQ0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms