Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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