Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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