Protein–RNA interactions for Protein: Q8N668

COMMD1, COMM domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD1Q8N668 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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