Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC2Q8N158 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms