Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC71Q8IV32 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms