Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms