Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRRT2Q7Z6L0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRRT2Q7Z6L0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms