Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE3BQ7Z3V4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE3BQ7Z3V4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms