Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDZD4Q76G19 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms