Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BEND4Q6ZU67 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms