Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms