Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPOCD1Q6ZMY3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPOCD1Q6ZMY3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms