Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A10Q6U841 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A10Q6U841 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms