Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
CCDC171Q6TFL3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC171Q6TFL3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms