Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCD3Q6STE5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCD3Q6STE5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms