Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA5Q6Q788 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA5Q6Q788 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms