Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 DAGLB-210ENST00000497308 428 ntTSL 211.74□□□□□ -0.532e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 DFNA5-205ENST00000414428 571 ntTSL 411.69□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 PPFIBP1-210ENST00000540114 2645 ntTSL 211.61□□□□□ -0.552e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 C2orf82-204ENST00000448993 357 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.6□□□□□ -0.552e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF451-206ENST00000370711 609 ntTSL 411.55□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 PDHA1-211ENST00000492364 611 ntTSL 211.47□□□□□ -0.577e-18■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 DAGLB-208ENST00000482149 2378 ntTSL 211.44□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 HMBS-218ENST00000543821 562 ntTSL 410.9□□□□□ -0.662e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 DGKZ-209ENST00000525242 542 ntTSL 410.88□□□□□ -0.674e-8■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.682e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 DAGLB-206ENST00000462934 2589 ntTSL 210.66□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF451-205ENST00000370710 375 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.782e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 TERF2-203ENST00000566051 791 ntTSL 310.17□□□□□ -0.782e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 KRBA1-202ENST00000467333 699 ntTSL 29.86□□□□□ -0.832e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 SLC38A6-203ENST00000451406 1568 ntTSL 1 (best)7.76□□□□□ -1.176e-7■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 SLC38A6-204ENST00000491344 2501 ntTSL 1 (best)6.97□□□□□ -1.296e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 AGK-210ENST00000496784 921 ntTSL 36.85□□□□□ -1.312e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.322e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A6-213ENST00000529345 1734 ntTSL 26.74□□□□□ -1.336e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 R3HCC1L-203ENST00000370584 3372 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.362e-9■■■■■ 35.4
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PRPF8Q6P2Q9 PPFIBP1-218ENST00000619325 1565 nt6.38□□□□□ -1.392e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 SFXN1-211ENST00000515736 453 ntTSL 36.36□□□□□ -1.392e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.42e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 CCDC93-208ENST00000474546 452 ntTSL 36.31□□□□□ -1.42e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 MITD1-201ENST00000289359 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 SLC2A3-204ENST00000479059 870 ntTSL 26.17□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.422e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 ZCCHC17-209ENST00000627541 1158 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.432e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 MITD1-203ENST00000413710 1083 ntTSL 56.04□□□□□ -1.442e-6■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 HMBS-213ENST00000542345 882 ntTSL 36□□□□□ -1.452e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 KMT5B-202ENST00000323599 653 ntTSL 36□□□□□ -1.452e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 LIMD1-204ENST00000474665 513 ntTSL 36□□□□□ -1.459e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.452e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 DIABLO-207ENST00000446652 573 ntTSL 35.93□□□□□ -1.461e-6■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.472e-7■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.482e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 RBBP8-203ENST00000399721 2229 ntTSL 1 (best)5.78□□□□□ -1.482e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 FANCC-209ENST00000480712 680 ntTSL 35.78□□□□□ -1.482e-9■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 MITD1-204ENST00000422537 971 ntTSL 55.59□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 RAB18-203ENST00000423465 873 ntTSL 55.52□□□□□ -1.532e-12■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 THUMPD1-205ENST00000570231 1040 ntTSL 25.43□□□□□ -1.547e-18■■■■■ 35.4
PRPF8Q6P2Q9 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.552e-9■■■■■ 35.4
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