Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAVIN1Q6NZI2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms