Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSBN1Q5VWQ0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSBN1Q5VWQ0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms