Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SYCP2LQ5T4T6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYCP2LQ5T4T6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms