Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNI3KQ59H18 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNNI3KQ59H18 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms