Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP29Q52LW3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms