Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRY2Q49AN0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRY2Q49AN0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms