Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC153Q494R4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC153Q494R4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms