Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL40Q2TBA0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL40Q2TBA0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms