Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms