Protein–RNA interactions for Protein: Q17RP2

TIGD6, Tigger transposable element-derived protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD6Q17RP2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TIGD6Q17RP2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TIGD6Q17RP2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms