Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HMGN3Q15651 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HMGN3Q15651 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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