Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SKIV2LQ15477 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SKIV2LQ15477 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms