Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NFIXQ14938 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
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