Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM25Q14258 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM25Q14258 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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