Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPIDRQ14159 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPIDRQ14159 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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