Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CBFBQ13951 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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